数理科学学院2023第十四期研究生论坛

来源:数理科学学院 作者:张秋玉、王文灿审核:郑仟发布时间:2023-09-13 11:29 浏览次数:


应用数学与交叉科学研究中心生物信息学团队于2023年9月第2周组会按期举行,小组全体成员和各位导师共同参加。在这次组会上,由两名研三学生和一名研二学生分别汇报自己的研究进展,然后老师与同学们对汇报内容进行学术探讨,并对存在的问题给出相应的指导和建议。

孙睿:本次汇报的内容是自己的研究进展,主要讲了从随机微分方程的角度定量求解细胞分化的转移概率,根据细胞的基因调控,生灭过程和空间位置信息去定量分析细胞分化的过程。

窦博正:本次汇报的内容是自己的研究进展,钠离子通道中与疼痛相关基因有SCN3A,SCN9A,SCN10A和SCN11A,在之前的研究中已经查找了这些基因相关的其他基因,并收集了与之相关的抑制剂数据集,再通过机器学习方法预测了基因和数据集之间交叉靶点BA值。而后根据这些BA值对数据集中的分子进行筛选,筛选的条件包括:对9A和10A基因有效,对hERG无副作用等条件,找出了三个符合要求的先导化合物,这些先导化合物具有相当大的实际意义。

吴昊:本次汇报的内容是自己的研究进展,更高质量的核苷酸模板有助于提高Rna粗粒化模型全原子还原时的还原精度。针对于前期工作数据库中Rna长度分布不够均匀的情况,对数据库的构建进行了调整。考虑了更多如Rna/蛋白质/Dna杂合物、核糖体等结构。增加了用以描述/区分核苷酸的特征值纬度,便于更精准的进行聚类分析。结合成熟的手肘法/K-means,确定最佳的簇类并迭代分析。根据最终迭代簇的类中心与最近邻原则得到合适的核苷酸模板。

— 学生汇报照片展示 —