近日,国际期刊《Frontiers inBioinformatics》正式在线出版应用数学与交叉科学研究中心团队研究生题目为“RNAStat: An Integrated Tool for Statistical Analysis of RNA 3D Structures”的最新研究成果。该成果的主要完成人为中心研究生郭智浩、原莉等,通讯作者为数理科学学院、中心时亚洲副教授,该成果的在线发表,实现了2022年度学术论文发表的开门红。
RNA分子从携带遗传信息、参与蛋白质合成、催化生化反应和调节基因表达,到在细胞器中充当结构等分子各种生物过程中发挥着重要作用。RNA结构与其功能密切相关,因此了解RNA的三级结构对于理解其细胞功能至关重要。虽然基于已知RNA结构统计数据的准确评分功能是成功预测或评估RNA结构的关键组成部分,但很少有工具或web服务器可直接用于对RNA三级结构进行全面统计分析。
随着PDB中沉积的RNA结构数量的迅速增加,目前仍然需要一种方便访问RNA三级结构综合统计信息的可用工具。因此,时亚洲老师及其学生郭智浩等提出了一个新的工具,命名为RNAStat,专门用于RNA三级结构的统计分析。它可以用于计算三级结构层次、二级结构层次和原子层次的RNA三级结构的结构信息。此外,为了测试该工具的可用性,我们建立了一个非冗余的RNA三级结构数据集,并基于该数据集对RNA结构进行了全面的统计分析,这对RNA结构建模具有指导意义。
据悉,在刚刚过去的2021年度,中心紧紧围绕科研反哺教学、科研提升研究生人才培养质量这条主线,中心研究生共计发表高水平SCI、EI等学术论文10余篇,研究生培养质量明显提升。展望2022年,中心将以更加扎实的学风,进一步提高研究生研究水平,追踪国际主流研究方向,实现新的跨越。
论文链接:Frontiers | RNAStat: An Integrated Tool for Statistical Analysis of RNA 3D Structures | Bioinformatics (frontiersin.org)